腸内細菌叢が主のようです。ワクチンスパイクも同じなのですかね…。
ヒト微生物叢は SARS-CoV-2 に有利な変異の宝庫である
biorxiv.org 2023/11/16
Human microbiota is a reservoir of SARS-CoV-2 advantageous mutations
概要
SARS-CoV-2の変異は急速に出現しており、特にスパイクタンパク質の有利な変異は、感染力を高めたり、免疫逃避を引き起こしたりするため、パンデミックの予防と治療に大きな課題となっている。
しかし、このウイルスがどのようにして短期間に多数の有利な変異を獲得するのかは依然として謎のままだ。
今回私たちの研究は、ヒト微生物叢が懸念される変異体（VOC）の変異に寄与している可能性があることを示したものだ。
私たちは、ウイルス変異フラグメント (VMF) 内の変異と隣接する 6 アミノ酸 (aa) を特定し、国立バイオテクノロジー情報センター (NCBI) データベースで相同フラグメント (HF) を検索した。
得られた約 8000個の相同フラグメントのうち、スパイクタンパク質およびその他の外膜タンパク質の 61 個の変異が細菌で見つかり、これはすべての変異源の 62% を占め、自然の変異の割合よりも 12倍高かった。
これらの細菌種の約 70% はヒトの微生物叢に属し、主に腸または肺に分布しており、新型コロナウイルス感染症患者の組成パターンと同様の組成パターンを示した。
重要なことは、SARS-CoV-2 RNA依存性RNAポリメラーゼ（RdRp）は、変異を有する対応する細菌 mRNA を複製し、キメラ RNA を生成することだ。まとめると、SARS-CoV-2 はヒト微生物叢から変異を獲得し、元のウイルスの結合部位や抗原決定基に変化をもたらす可能性がある。